当山の開創は、慶長七年（1602）にさかのぼります。当山はその昔、豊臣秀吉や徳川家康等の時代に活躍した名君である、
第百七代天皇、後陽成帝（ごようぜいてい）が晩年の一時期を過ごされた草庵に始まると言われます。
その後、この草庵は九州松尾山光勝寺（まつおざんこうしょうじ）（日蓮宗）の江戸出張所として改められ、
松尾山十九世、尊重院日億（そんじゅういんにちおく）上人によって「松流山正伝寺」の名で正式に建立されました。